The dynamics of introgression across an adaptive radiation: examining hybrid speciation and parallel adaptation in North American Vitis

Este estudo analisa dados de resequenciamento de genoma completo de 639 acessos de 48 espécies de *Vitis* na América do Norte, revelando que a introgressão é generalizada (compondo cerca de 14% do genoma), está associada a margens de nicho ecológico, e impulsiona a adaptação paralela através da partilha de variação genética, desafiando a distinção de algumas espécies híbridas como "swarms" em vez de táxons distintos.

Wang, T., Fiscus, C., Landis, J. + 5 more2026-02-24📄 evolutionary biology

Annelid eye evolution revealed by developmental, ultrastructural, and connectome analyses of cerebral eyes in Malacoceros fuliginosus

Este estudo integra análises de desenvolvimento, ultraestrutura e conectoma dos olhos cerebrais de *Malacoceros fuliginosus* para demonstrar que a diversidade ocular nos anelídeos resulta de uma duplicação ancestral precoce, gerando pares de olhos com funções específicas em cada estágio.

Kumar, S., Seybold, A., Tolstenkov, O. + 2 more2026-02-23📄 evolutionary biology

Frequency-dependent fitness effects are ubiquitous

Este estudo demonstra que os efeitos de aptidão dependentes da frequência são ubíquos em populações microbianas, ocorrendo na maioria dos pares de cepas testadas do experimento de evolução a longo prazo de *E. coli*, o que desafia a suposição de aptidão constante e revela que interações sutis entre genótipos podem alterar fundamentalmente as trajetórias evolutivas.

Ascensao, J. A., Abedi, K. D., Prasad, A. N. + 1 more2026-02-22📄 evolutionary biology

Divergence in the Pelagic Zone: Genomic Signatures of Speciation and Adaptation in the Ctenophore Mnemiopsis

Este estudo genômico revela que o ctenóforo *Mnemiopsis leidyi* na costa atlântica dos EUA na verdade compreende duas espécies distintas, *M. leidyi* e *M. gardeni*, que divergiram durante as transições climáticas do Pleistoceno e foram moldadas por mudanças oceanográficas pós-glaciais, destacando rearranjos genômicos e genes sob seleção como fatores-chave para a adaptação e especiação em ambientes pelágicos.

Ketchum, R. N., Smith, E. G., Toledo, L. + 5 more2026-02-21📄 evolutionary biology

Single-cell transcriptomics reveals transcriptional diversity of sea cucumber perivisceral fluid coelomocytes

Este estudo pioneiro utiliza sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-seq) em coelomócitos de *Holothuria forskali* para identificar 10 populações transcricionais distintas, incluindo células progenitoras e carotenócitos, esclarecendo a diversidade funcional e molecular do sistema imunológico dos holotúrios.

Wambreuse, N., Lavergne, A., Fievez, L. + 6 more2026-02-21📄 evolutionary biology

Breaking the species barrier: recurrent genomic introgressions from very distant lineages in a ciliate

Este estudo revela que o ciliado *Paramecium sonneborni* superou barreiras de espécies extremamente divergentes através de introgressões genômicas recorrentes, um fenômeno viável graças à separação entre funções somáticas e germinativas que permite a eliminação de DNA estranho no genoma somático enquanto mantém a viabilidade e fertilidade da prole.

Benitiere, F., Arnaiz, O., Penel, S. + 4 more2026-02-21📄 evolutionary biology

Co-occurrence of Yersinia pestis and other zoonoses during European prehistory

Este estudo apresenta a mais antiga evidência de *Yersinia pestis* na península italiana, datada de aproximadamente 4950 cal AP, revelando um caso de coinfecção com *Erysipelothrix rhusiopathiae* e Vírus da Hepatite B em um indivíduo da Grotta della Spinosa, além de expandir o conhecimento sobre a dinâmica de doenças e reservatórios zoonóticos na Europa pré-histórica através da análise de 60 novos genomas antigos de *Erysipelothrix*.

de-Dios, T., Bonucci, B., Thompson, J. E. + 19 more2026-02-21📄 evolutionary biology

A covarion model for phylogenetic estimation using discrete morphological datasets

Este estudo apresenta o modelo "covariomorph" no RevBayes, que estende o modelo covarion para dados morfológicos ao permitir variações de taxa específicas de linhagem e caráter, demonstrando através de simulações e dados empíricos que essa abordagem melhora a precisão da inferência filogenética, afetando significativamente a topologia das árvores e os comprimentos dos ramos em comparação com modelos tradicionais.

Khakurel, B., Hoehna, S.2026-02-20📄 evolutionary biology

Evolutionary rescue in a consumer-resource system depends on the affected ecological traits and the population's resident life-history

Este estudo demonstra que a probabilidade de resgate evolutivo em um sistema consumidor-recurso depende criticamente de quais traços ecológicos são afetados pela mudança ambiental e da história de vida residente da população, indicando que a medição isolada das taxas de crescimento intrínsecas é insuficiente para prever a persistência populacional.

Hasan, A., Whitlock, M. C.2026-02-20📄 evolutionary biology

Population-scale discovery and analysis of non-reference endogenous retrovirus insertions in wild house mice

Este estudo realiza a primeira varredura genômica populacional em larga escala de inserções de retrovírus endógenos não referenciados em 163 camundongos domésticos selvagens, revelando uma diversidade estrutural significativa, padrões evolutivos distintos entre subespécies e o papel adaptativo desses elementos, exemplificado pela introgressão do locus Fv4.

Yano, T., Takada, T., Fujiwara, K. + 5 more2026-02-20📄 evolutionary biology

Context-dependent selection and genetic facilitation and constraint on rosette diameter and herbivore resistance across European outdoor common gardens under ambient and reduced precipitation in Fragaria vesca

Este estudo demonstra que a evolução da resistência a herbívoros e do diâmetro da roseta em *Fragaria vesca* é altamente dependente do contexto ambiental, onde a interação entre seleção variável e covariâncias genéticas específicas de cada local pode tanto facilitar quanto restringir as respostas evolutivas, especialmente sob condições de seca.

De-la-Cruz, I. M., Diller, C., Batsleer, F. + 9 more2026-02-20📄 evolutionary biology

Geoclimatic oscillations and ancient reciprocal adaptive introgression shape the evolutionary trajectories of threatened Coilia

Este estudo demonstra que oscilações geoclimáticas e a introgressão adaptativa recíproca antiga moldaram a evolução e a persistência de linhagens de *Coilia* ameaçadas, permitindo a troca de genes benéficos relacionados à imunidade e osmorregulação antes do isolamento completo durante as glaciações do Pleistoceno.

Fu, Z., Wang, H., Feng, Y. + 9 more2026-02-20📄 evolutionary biology

Deep models of protein evolution in time generate realistic evolutionary trajectories and functional proteins

O artigo apresenta o PEINT, um modelo de aprendizado profundo que simula trajetórias evolutivas realistas de proteínas ao capturar interações complexas entre sítios e dinâmicas de inserção-deleção diretamente de sequências não alinhadas, gerando variantes funcionais que validam experimentalmente sua eficácia.

Koehl, A., Prillo, S., Liu, M. + 4 more2026-02-20📄 evolutionary biology

A pleiotropic hitchhiking model recapitulates alignments between fly wing divergence and variation

Este artigo propõe e valida um modelo de "arrasto pleiotrópico" que resolve o paradoxo da taxa de evolução da forma da asa em *Drosophila*, demonstrando que a seleção univariada sobre o tamanho da asa, combinada com a estrutura da variância mutacional, é suficiente para explicar o alinhamento observado entre a divergência macroevolutiva e a variação genética, sem a necessidade de invocar custos pleiotrópicos ocultos em outras características.

Cai, H.2026-02-20📄 evolutionary biology

Environmental and geographic drivers of global bat phylogenetic diversity

Este estudo global demonstra que dados genéticos de um único locus podem ser utilizados para mapear a diversidade filogenética de morcegos, revelando que variáveis de temperatura com componente histórico são os principais preditores em larga escala, enquanto a latitude e a densidade populacional ganham relevância em escalas espaciais menores, fornecendo assim informações cruciais para estratégias de conservação.

Green, A., Calderon-Acevedo, C., Soto-Centeno, J. A. + 1 more2026-02-19📄 evolutionary biology